《<柳如是别传>读后》，《纪念陈寅恪教授国际学术讨论会文集》，中山大学出版社1989年

《<生绡剪>的作期和艺术价值》，《庆祝邓广铭教授九十华诞论文集》，1997年 

《<四库禁毁书丛刊>编纂缘起》，《四库禁毁书丛刊》第1册，1997年 

《<天地会起源研究>序》，《中国社科院研究生院学报》1995年第6期 

《悼念商鸿逵师》（合撰），《清史论丛》第6辑，中华书局 

《悼念谢国桢先生》，《清史论丛》第5辑，中华书局1984年 

《读<清代洪门史>》，《中国史研究动态》1995年第3期 

《读顾诚<南明史>》，《中国史研究》1998年第3期 

《读李兴盛著<东北流人史>》，《清史论丛》第8辑，中华书局1991年 

《封建贵族大地主的典型——孔府研究》（合著），中国社会科学出版社1981年9月 

《关于柳敬亭的生年及其他——与陈汝衡先生商榷》，《清史论丛》第3辑，中华书局1982年 

《关于王紫稼》，《清史研究通讯》1984年第3期 

《关于魏耕通海案的几个问题》，《文史哲》1993年第2期 

《湖南的抗清复明活动与陶汝鼐案》，《明史论丛》，中国社会科学出版社1997年 

《李长祥的复明活动——附论清初关于赦除前罪的政策》，《庆祝王钟翰先生八十寿辰学术论文集》，辽宁大学出版社1993年 

《李之椿案与复明运动》，《中国史研究》1990年第3期 

《历史的审判——“四人帮”影射史学剖析》（合著），中国社会科学出版社1979年8月 

《刘泽清之死的疑案以及他与闻香教的关系等问题》，《清史研究通讯》1985年第1期 

《旅日高僧隐元中土往来书信集》（合编），中华全国图书馆文献缩微复制中心1995年3月 

《略论<明遗民录汇辑>的整理》，《古籍整理出版情况简报》324期1997年 

《论石达开从天京事变到被害时的活动》（合著），《石达开论集》，四川人民出版社1983年 

《民族艺人苏崑生考述》，《庆祝王钟翰教授八十五暨韦庆远教授七十华诞学术论文合集》，1999年 

《明甭的隔壁戏》，《清史论丛》1994，辽宁古籍出版社1994年 

《平一统贺王盛复明案始末》，《历史档案》1990年第1期 

《清初京师吸烟风等几个问题》，《清史论丛》1999，河北教育出版社2001年 

《清代人物传稿》上编第7卷（合编），中华书局1994年7月 

《清代人物传稿》上编第二卷（合编），中华书局1986年2月 

《清代人物传稿》上编第六卷（合编），中华书局1991年4月 

《清代人物传稿》上编第四卷（合编），中华书局1987年4月 

《曲阜孔府档案史料选编》第二编（明代档案史料），合编，齐鲁书社1980年8月 

《曲阜孔府档案史料选编》第三编（清代档案史料），合编，齐鲁书社1980年11月—1985年5月 

《山海关石河之战始末》，（台湾）《历史月刊》第81期，1994年 

《史可法扬州督师期间的幕府人物》（上），《燕京学报》新3期，1997年 

《史可法扬州督师期间的幕府人物》（下），《燕京学报》新4期，1998年 

《试论中国农民战争和宗教的关系》（合撰），《人民日报》1960年10月7日 

《四库禁毁书研究》（合著），北京出版社1999年11月 

《太平天国革命战争》（合著），三联书店1962年5月 

《太平天国运动史》（合著），人民出版社1986年2月 

《吴祖锡的复明活动》，《周一良先生八十生日纪念论文集》，中国社科出版社1993年 

《五库斋清史丛稿》，学苑出版社2005年 

《杨鹍空敕案——清初江南又一起复明运动》，《第二届明清史国际学术讨论会论文集》，天津人民出版社1993年3月 

《再谈关于柳敬亭的几个问题》，《商鸿逵教授逝世十周年纪念文集》，北京大学出版社1995年 

《浙江奏销案》，《庆祝杨向奎先生教研六十年论文集》，1998年 

《郑成功和施琅》（合撰），《郑成功研究论文选续集》，福建人民出版社1984年 

《中国近代清史学科的萌生》，《中国历史博物馆馆刊》第13-14期合刊 

《中国近代清史学科的一位杰出奠基人——试论孟森的清史研究成就，为纪念他的诞辰一百二十周年而作》，《清史论丛》第8辑，中华书局1991年