秘书组是国家清史编纂委员会常设的综合性管理部门，是编委会主任及主任办公会议的办事机构。

秘书组的职责是承担编委会主任及主任办公会议布置的工作事项，做好编委会主任、副主任的助理工作，发挥作为编委会领导班子的助手以及信息枢纽作用。 

具体工作职责包括： 

1 负责编委会主任、副主任的秘书工作，协助领导做好各自分管部门的管理和联系，起草编委会重要文件和领导讲话稿，安排并参加编委会主任办公会议、编委会部门联席会议以及其他日常工作会议； 

2 与清史办有关部门协同处理编委会的办公室日常事务，安排编委会领导的出行、接待等日常事务，组织、协调编委会重大事项和大型活动，开展对外联络和宣传，接待重要来宾； 

3 负责编委会委员的联络工作，负责编委会工作会议的学术组织工作，做好录音整理和会议文件、纪要、新闻通稿的草拟及编印，协助清史办有关部门搞好会议服务工作； 

4 负责编委会各部门之间的综合协调以及相关工作的督促落实；负责编委会内部的文件收发、运转、处理和保密工作；负责执行“工作报告制度”，编印《清史编纂通讯》；负责清史编纂工程信息的搜集、汇总以及重要数据的统计工作；设立文件档案库，收集和保管编委会重要文件档案； 

5 负责编委会与清史办各部门的联络、协作及配合工作； 

6 参与编委会领导安排的有关学术研究工作； 

7 承担编委会领导交办的其他工作。 

 秘书组负责人先后为王江、董建中、王立新，现为刘文鹏。